Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dgcr6O35347 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms