Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casq1O09165 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Casq1O09165 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casq1O09165 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Casq1O09165 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casq1O09165 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casq1O09165 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casq1O09165 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casq1O09165 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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