Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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