Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arfgef1G3X9K3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms