Protein–RNA interactions for Protein: F7CCV5

Gm3443, Predicted gene 3443, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3443F7CCV5 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms