Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Rdh9-201ENSMUST00000052652 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Ikbkg-201ENSMUST00000004330 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Gm7967-202ENSMUST00000191042 5042 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Adam22-204ENSMUST00000088761 9077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Nrp2-205ENSMUST00000114155 6534 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Nckap5-208ENSMUST00000161954 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Map1a-202ENSMUST00000110639 10145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Pknox1-201ENSMUST00000097352 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Frmpd1-201ENSMUST00000044773 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Stau1-202ENSMUST00000109235 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Rbm10-204ENSMUST00000115374 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Ncam1-204ENSMUST00000193547 6050 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 4930552P12Rik-201ENSMUST00000181198 2496 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms