Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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