Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc6D3YZP9 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89 ms