Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms