Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Phf11cB4XVP9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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