Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp26c1B2RXA7 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms