Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AU015836B2RUM3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AU015836B2RUM3 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AU015836B2RUM3 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AU015836B2RUM3 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AU015836B2RUM3 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
AU015836B2RUM3 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AU015836B2RUM3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AU015836B2RUM3 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AU015836B2RUM3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AU015836B2RUM3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AU015836B2RUM3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AU015836B2RUM3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AU015836B2RUM3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AU015836B2RUM3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AU015836B2RUM3 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AU015836B2RUM3 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AU015836B2RUM3 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AU015836B2RUM3 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AU015836B2RUM3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AU015836B2RUM3 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AU015836B2RUM3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AU015836B2RUM3 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AU015836B2RUM3 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AU015836B2RUM3 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AU015836B2RUM3 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AU015836B2RUM3 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AU015836B2RUM3 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AU015836B2RUM3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AU015836B2RUM3 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AU015836B2RUM3 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AU015836B2RUM3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AU015836B2RUM3 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AU015836B2RUM3 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AU015836B2RUM3 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AU015836B2RUM3 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AU015836B2RUM3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AU015836B2RUM3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AU015836B2RUM3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AU015836B2RUM3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AU015836B2RUM3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AU015836B2RUM3 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AU015836B2RUM3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AU015836B2RUM3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AU015836B2RUM3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AU015836B2RUM3 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms