Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Gm17983-201ENSMUST00000190766 594 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Gm1866-201ENSMUST00000120701 477 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Gm8902-201ENSMUST00000174341 1096 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Olfr886-ps1-201ENSMUST00000212395 708 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Tprkb-202ENSMUST00000089570 1216 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Gm45587-201ENSMUST00000211548 765 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 4930442G15Rik-201ENSMUST00000213112 1000 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apba1B2RUJ5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms