Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Ssxb8B1AY40 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Ssxb8B1AY40 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Ssxb8B1AY40 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Ssxb8B1AY40 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Ssxb8B1AY40 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Ssxb8B1AY40 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Ssxb8B1AY40 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Ssxb8B1AY40 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Ssxb8B1AY40 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Ssxb8B1AY40 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Ssxb8B1AY40 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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