Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms