Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ArcQ9WV31 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms