Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slit2Q9R1B9 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms