Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prkab1Q9R078 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms