Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms