Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms