Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms