Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Rabgef1Q9JM13 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Rabgef1Q9JM13 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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