Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL16

Isg20, Interferon-stimulated gene 20 kDa protein, mousemouse

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Length 300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Isg20Q9JL16 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Isg20Q9JL16 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Isg20Q9JL16 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Isg20Q9JL16 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Isg20Q9JL16 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms