Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms