Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms