Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms