Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ5

Ndufa8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa8Q9DCJ5 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufa8Q9DCJ5 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms