Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzd9Q9D9M4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms