Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tvp23bQ9D8T4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tvp23bQ9D8T4 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tvp23bQ9D8T4 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tvp23bQ9D8T4 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tvp23bQ9D8T4 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tvp23bQ9D8T4 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tvp23bQ9D8T4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Tvp23bQ9D8T4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tvp23bQ9D8T4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tvp23bQ9D8T4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tvp23bQ9D8T4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tvp23bQ9D8T4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tvp23bQ9D8T4 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tvp23bQ9D8T4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tvp23bQ9D8T4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tvp23bQ9D8T4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tvp23bQ9D8T4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tvp23bQ9D8T4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tvp23bQ9D8T4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tvp23bQ9D8T4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tvp23bQ9D8T4 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tvp23bQ9D8T4 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tvp23bQ9D8T4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tvp23bQ9D8T4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tvp23bQ9D8T4 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tvp23bQ9D8T4 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tvp23bQ9D8T4 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tvp23bQ9D8T4 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tvp23bQ9D8T4 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tvp23bQ9D8T4 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tvp23bQ9D8T4 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tvp23bQ9D8T4 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tvp23bQ9D8T4 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tvp23bQ9D8T4 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tvp23bQ9D8T4 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tvp23bQ9D8T4 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tvp23bQ9D8T4 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tvp23bQ9D8T4 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tvp23bQ9D8T4 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tvp23bQ9D8T4 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tvp23bQ9D8T4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tvp23bQ9D8T4 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tvp23bQ9D8T4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tvp23bQ9D8T4 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tvp23bQ9D8T4 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tvp23bQ9D8T4 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tvp23bQ9D8T4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tvp23bQ9D8T4 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tvp23bQ9D8T4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tvp23bQ9D8T4 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tvp23bQ9D8T4 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tvp23bQ9D8T4 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tvp23bQ9D8T4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tvp23bQ9D8T4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tvp23bQ9D8T4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tvp23bQ9D8T4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Tvp23bQ9D8T4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tvp23bQ9D8T4 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tvp23bQ9D8T4 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tvp23bQ9D8T4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tvp23bQ9D8T4 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tvp23bQ9D8T4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tvp23bQ9D8T4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tvp23bQ9D8T4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tvp23bQ9D8T4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tvp23bQ9D8T4 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tvp23bQ9D8T4 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tvp23bQ9D8T4 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tvp23bQ9D8T4 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tvp23bQ9D8T4 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tvp23bQ9D8T4 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tvp23bQ9D8T4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tvp23bQ9D8T4 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tvp23bQ9D8T4 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tvp23bQ9D8T4 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tvp23bQ9D8T4 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tvp23bQ9D8T4 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tvp23bQ9D8T4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tvp23bQ9D8T4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tvp23bQ9D8T4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tvp23bQ9D8T4 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tvp23bQ9D8T4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tvp23bQ9D8T4 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tvp23bQ9D8T4 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tvp23bQ9D8T4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms