Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T0

Fam3a, Protein FAM3A, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam3aQ9D8T0 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms