Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms