Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms