Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ61

Gm17509, Predicted gene, 17509, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17509Q9CZ61 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17509Q9CZ61 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17509Q9CZ61 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17509Q9CZ61 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17509Q9CZ61 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17509Q9CZ61 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17509Q9CZ61 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17509Q9CZ61 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17509Q9CZ61 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17509Q9CZ61 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17509Q9CZ61 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17509Q9CZ61 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17509Q9CZ61 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17509Q9CZ61 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17509Q9CZ61 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17509Q9CZ61 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm17509Q9CZ61 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm17509Q9CZ61 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm17509Q9CZ61 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm17509Q9CZ61 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm17509Q9CZ61 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm17509Q9CZ61 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm17509Q9CZ61 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm17509Q9CZ61 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm17509Q9CZ61 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm17509Q9CZ61 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm17509Q9CZ61 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm17509Q9CZ61 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms