Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY50

Ssr1, Translocon-associated protein subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr1Q9CY50 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr1Q9CY50 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms