Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms