Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atxn3Q9CVD2 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atxn3Q9CVD2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atxn3Q9CVD2 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atxn3Q9CVD2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atxn3Q9CVD2 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atxn3Q9CVD2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atxn3Q9CVD2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atxn3Q9CVD2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atxn3Q9CVD2 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atxn3Q9CVD2 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atxn3Q9CVD2 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atxn3Q9CVD2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atxn3Q9CVD2 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atxn3Q9CVD2 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atxn3Q9CVD2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atxn3Q9CVD2 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atxn3Q9CVD2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atxn3Q9CVD2 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atxn3Q9CVD2 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atxn3Q9CVD2 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Atxn3Q9CVD2 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atxn3Q9CVD2 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atxn3Q9CVD2 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atxn3Q9CVD2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atxn3Q9CVD2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atxn3Q9CVD2 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Atxn3Q9CVD2 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Atxn3Q9CVD2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atxn3Q9CVD2 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atxn3Q9CVD2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atxn3Q9CVD2 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atxn3Q9CVD2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atxn3Q9CVD2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atxn3Q9CVD2 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atxn3Q9CVD2 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atxn3Q9CVD2 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atxn3Q9CVD2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atxn3Q9CVD2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atxn3Q9CVD2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atxn3Q9CVD2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms