Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms