Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms