Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQC3 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CQC3 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CQC3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CQC3 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CQC3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CQC3 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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