Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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