Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Higd1bQ99JY6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Higd1bQ99JY6 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Higd1bQ99JY6 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1bQ99JY6 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
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Higd1bQ99JY6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Higd1bQ99JY6 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Higd1bQ99JY6 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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