Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms