Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.4 ms