Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Creb3l3Q91XE9 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Creb3l3Q91XE9 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Creb3l3Q91XE9 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Creb3l3Q91XE9 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Creb3l3Q91XE9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Creb3l3Q91XE9 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Creb3l3Q91XE9 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Creb3l3Q91XE9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l3Q91XE9 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l3Q91XE9 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l3Q91XE9 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l3Q91XE9 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l3Q91XE9 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l3Q91XE9 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l3Q91XE9 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l3Q91XE9 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l3Q91XE9 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l3Q91XE9 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l3Q91XE9 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l3Q91XE9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l3Q91XE9 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l3Q91XE9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l3Q91XE9 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l3Q91XE9 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l3Q91XE9 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l3Q91XE9 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l3Q91XE9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l3Q91XE9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l3Q91XE9 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l3Q91XE9 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l3Q91XE9 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l3Q91XE9 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l3Q91XE9 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l3Q91XE9 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms