Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Ubxn4Q8VCH8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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