Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

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Length 587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Nup58Q8R332 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Nup58Q8R332 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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Nup58Q8R332 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Nup58Q8R332 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup58Q8R332 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup58Q8R332 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup58Q8R332 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup58Q8R332 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup58Q8R332 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup58Q8R332 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup58Q8R332 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup58Q8R332 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup58Q8R332 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup58Q8R332 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup58Q8R332 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup58Q8R332 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup58Q8R332 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup58Q8R332 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup58Q8R332 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup58Q8R332 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup58Q8R332 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup58Q8R332 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup58Q8R332 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup58Q8R332 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup58Q8R332 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup58Q8R332 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup58Q8R332 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup58Q8R332 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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