Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
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