Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Znf628Q8CJ78 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Znf628Q8CJ78 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Znf628Q8CJ78 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Znf628Q8CJ78 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Znf628Q8CJ78 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Znf628Q8CJ78 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
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Znf628Q8CJ78 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Znf628Q8CJ78 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Znf628Q8CJ78 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Znf628Q8CJ78 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Znf628Q8CJ78 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Znf628Q8CJ78 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Znf628Q8CJ78 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Znf628Q8CJ78 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Znf628Q8CJ78 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Znf628Q8CJ78 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Znf628Q8CJ78 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Znf628Q8CJ78 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Znf628Q8CJ78 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Znf628Q8CJ78 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Znf628Q8CJ78 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Znf628Q8CJ78 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Znf628Q8CJ78 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Znf628Q8CJ78 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Znf628Q8CJ78 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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