Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ep400Q8CHI8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms