Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms